顾净缘云：“有函索七佛药师经者，因尽舍陈腐科判注疏，依据事相从新分标经文节目，另写读法寄之。”是为顾老依据事相而不为文字所拘泥，开启注释药师经法的新篇章。（见《药师经法研究3、4辑》）
顾净缘对药师经提出“七大解读新说”，有五说为“独创”。

2.1第一说：佛是大医王，究竟拔苦启正觉

第一说，不可以庸俗的“消灾延寿”四字作主观来读药师经。不可以世俗的“消灾延寿”四字解读药师经，如此则遮蔽了药师经博大精深的内义。

佛书多说“佛是大医王”，医治众生身病和众生心病。“药师佛是以实际药物医治众生病苦之觉者，以众生生活资料之饮食衣服为药，以众生生命本质之精血气力为药，亦以众生清净解脱之觉悟智慧为药，其施治救苦则在教人不自悭贪而人我平等，不自执著而生死一如，亦皆必按照现前界地踏实起修。”

“经中所谓东方，不过为劝活人养生而非同死人捣鬼。”

“经中所谓国土，不过表示自我如理转变而身、世即随进展。”

“如此读法，才免入迷信。”这是顾老以科学之说融通佛法的当机之举，也是顾老远离我法二执的究竟彻底的圆觉境界。

在这一点上顾老与太虚大师、弘一大师观点颇为一致。

太虚大师受宁波阿育王寺之请，讲《药师本愿经》谓：“中国自唐宋以来，于佛法注重救度亡灵或临终往生，偏向弥陀法门，故以弥陀法门，最极弘盛。中国人有不知释迦与药师之名者，而弥陀则人人皆知，可见唐宋后之中国佛教，偏于度亡方面，信而有征矣。由此之故，社会人民往往有认佛教为度死人之所用；死后方觉需要，而非人生之所须，是甚昧于佛教之全体大用。”又谓：“然此资生之佛教，即为释迦付託与药师之法门，而说明在此经中者；此于过去专重度亡之佛教，有补偏救弊之功能，尤合于现代人类生活相资相养之关係。”又谓：“故今日之学佛者，应将药师如来如何发愿修行之方法，牢记于心，孤掌难鸣，众擎易举，集众人之力量，方可转此污浊恶世娑婆，为清净琉璃也。”

弘一法师在《药师如来法门略录》说：“今人持名者皆曰‘消灾延寿药师佛’似未尽善，佛名惟举“药师”二字未能具足。佛德惟举“消灾延寿”四字亦多所缺略，故须依据经文而曰‘药师琉璃光如来’斯为最妥善矣。”
弘一法师在《药师如来法门一斑》说“最后，再就持念药师佛名的方法，略说一下。念佛名时，应依经文，念曰‘南无药师琉璃光如来’，不可念消灾延寿药师佛。”

太虚大师于《药师经讲记》中说：“依此《药师佛》而作延生法事，虽尚流行于中国，然能讲解修行者，则如凤毛麟角。就吾数十年足迹之所至处，皆未遇见讲习此经者。今能于此释迦如来舍利道场之阿育王寺宣讲此经，亦诚为现代佛教中极可纪念之盛世也！”

2.2第二说：七佛本是一佛，净土本是定境

第二说，七佛本是一佛。顾老直说“七佛本是一佛”，“七佛国土庄严本是一人七重定境”，“七佛本愿亦皆愿众生衣食充足、无病无恼、养生送死无有缺憾”。顾老曾将释迦摩尼佛诞辰2500年（即1956年）订为药师年，书云：“我抖擞宿愿，订今年日诵此经，每觉我现前环境如在净琉璃世界也。又结合科学，用‘气功’、‘息道’方法修药师定，病亦时见减轻。我又自寻许多新人新事，心想当来社会美景，深恨早年偏执药师如来远在十殑伽河沙之外为大错也。我以为七佛药师经当如是诵读，当如是求其实用，不当以其文句朴拙、表法秘奥而轻弃之。”  

这里面有两层含义是突破经文表面字意的深密阐释。第一层是“七佛本是一佛”，七佛药师，各有本愿。第一、二、三位是他们各自在世法中治病救人的本愿，第四、五、六是他们在出世法中治病救人的本愿。其实这六位皆是药师琉璃光如来一个人的本愿。一个人的愿行，必得因时当机，时有先后，机有利钝，治病救人，对症下药。所以玄奘传一佛药师，义净传七佛药师，皆一佛当不同之机所化现也。七佛只是一佛，一佛不妨七佛。七佛不过说明一佛行愿的先后次序，一佛也即是七佛全体的智慧功德。佛者觉也，七佛就是七位觉悟的思想，一佛就是圆满的一位。

第二层是“七佛国土庄严本是一人七重定境”，既然是定境，就不能把七佛世界看作是“从东方过此四殑伽河沙佛土”乃至“十殑伽河沙佛土”的遥远的外部世界。在现实世界里，别说四条恒河沙，就是一公里长的恒河沙已不可数，何况十条恒河沙数量的佛土！佛陀说法用的是比喻，是描述不可思议境界的方便说。既然是定境就是人人可修、人人可期的境界世界，这样拉近了佛世界和人世界的距离。诸佛世界不在遥不可及。故顾老痛言“深恨早年偏执药师如来远在十殑伽河沙之外为大错也”，深信当来社会美好，可以依药师本愿建立人间净土。

2.3第三说密：咒依于师承，诵经也得效验

第三说，对于经中的陀罗尼，当依声明受学，若不明声字实相，徒多诵读无益。

顾老云：“经中说五陀罗尼，当依精通声明及十六旋义者受学，若不明声字实相，徒多诵读无益，外人闻之，不识此无意味语，尤易兴谤。若作“真语即真言”之义，唯在依经行愿，从做人做事上清净三业，始得发不思议业用。故玄奘法师译《药师本愿经》不译一咒。不得师传者，且读经文亦可。”

顾老于1927年赴日参学东密和台密，1928年在日本醍醐流三宝院受两部传法灌顶，证大阿阇黎位。对真言口密自然是稔熟，东密、台密梵呗、悉昙皆完备， 顾老也必修学声明。早有吴老口传言，顾老早年尤善歌咏及幽默讲笑。此皆通达声明之相。今发狮吼言“若不明声字实相，徒多诵读无益”，实也针对有口无心的机械念诵，针砭时弊，振聋发聩。又另一面说明学密咒依师传的重要，因此说“经中说五陀罗尼，当依精通声明及十六旋义者受学”，“不得师传者，且读经文亦可”。

2.4第四说：以究竟的“无神境界”和缘生观看待药师经所说的现象

第四说，经中所说“十二药叉大将”应对应十二时辰，宜从人类环境动态的十二阶段来考虑。因此，在中国文化里十二时辰有十二生肖来分别代表，十二生肖又对应十二药叉大将。因此，究竟来说十二药叉代表时间轮。佛教的轮，代表生命的轮回和缘起性空，消极的一面是表示无常的轮转，积极的一面是表示推动正见、正行和正业循环往复乃至无穷。尊重药叉就是尊重时间的规律，尊重事物时间的业力。如是解读则十二药叉大将，除有宗教的想像外，更多可做业力与科学的解读。例如中医人体的十二经络也可配十二药叉，而十二经络之子午流注学说就是中医内经的实践科学。

顾老依实证科学地解读药师经，对“神识”“俱生神”“琰魔王”等形象概念皆可作业力解，如实观照业力，则种种现象也皆可作究竟的“无神境界”而解。

顾老云：“经中说‘十二药叉大将’，教相以配十二时，读者不妨以作‘动的十二阶段’看。经中说“神识”“俱生神”者，生时精血气力之具体谓之“神识”，死后余势未减时谓之“俱生神”，读者亦不妨从“自我之我”上看。经中说“琰魔法王之使”及“彼王”者，注疏以为众生共业所感，有是业力，乃有是业用之现象，不可执有，亦不必拨无，惟死后境界死前难于理解。我劝读者修药师定，看息断脉定时是何景象，若得清淨光明，始与实证无神境界，则虽经说诸佛菩萨名号及诸成就法事，皆不妨作如是观，此大日经所以说缘生观也。读者遇此等不可解处，直需魔来斩魔佛来斩佛，一切不著为要。”
 

2.5第五说：超越自私小我，践行十二大愿

第五说，药师经是大乘菩萨修学菩提心行愿的经典指南，不仅仅是为个人消灾除难的宝典手册。因此修学药师大法，首先是学发药师十二大愿，修药师大定，入生生悉地，住琉璃光界。
顾老云“此是大乘经典，处处就众生立言，且就众生生活实际显示般若与业力之关係，与近代社会经济科学亦不无一二可以会通之处。读者当发菩萨愿，忘我为人自能随处体会，若以个人消灾延寿之心读此经则必不契佛意，没有益外，反而增长自私自利之念，虚劳妄想，不如不读。”
 秉持大乘利他精神，忘我为人，为契佛意的读经法。
 

2.6第六说：化古从新扬当代，不见迹象益众生

第六说，大乘行人应依现代觉者领导，发挥古代光明，为众人谋幸福，而后化古从新不见迹象。

顾老云：“经说会中天众，不知过去远方世界何以能影像现前环境，我解作是说明历史性的重要，及他方此土之本相联繫。经又说释迦入定七佛应召自来，我解作是过去现在息息相关，此身彼土一念昭昭。经又说七如来以一音声护念加持，我解作是七佛即一佛，一佛即释迦，现前释迦是主，过去七佛是宾，宾主交融成就当来。经又说执金刚先礼释迦佛后礼七如来，各于佛前，自立要誓：为欲饶益一切众生皆得安乐。而后东方七佛忽然不现。我解作是大乘行人，应依现代觉者领导，发挥古代光明，为众人谋幸福，而后化古从新不见迹象也。此大段经文，不见奘师译本，亦无疏解，我自逞私臆，自不免武断附会之嫌。此经于藏密台密甚为尊重，乃至南洋诸佛教国家亦颇行用，然皆于经义少有发明；旧时应赴僧徒，每藉此经逢迎施主，更多胡说。今既挖掘得此宝物，窃愿众力刮垢磨光，倘读者于此，得有正解，还乞教我。”
 

2.7第七说：药师法是圆融、圆满世出世间的佛法

第七说，药师法是“圆融大小、圆融显密、圆融真俗、圆融二世”的圆满佛法。

自最初帛尸梨蜜多罗翻译《佛说灌顶拔除过罪生死得度经》以来，至义净三藏译出《七佛药师经》，药师法具备了最完整的经典。

顾老云：“药师法是圆满世出世间之法，是圆通显密之法，是释迦、大日、药师一体，本尊、本师一具之法，是般若空、般若不空双显之法，是法性、法相双融之法，是曼殊室利、执金刚对扬之法，是了生脱死，即在生活上了生死，以药物为第一性、性空为第二性，来认识人生而改造人生，不离实际不尚空谈，现前脚下立地起修之大法也。”

顾老于1956年开示此法，正值中华人民共和国建国初期，国家百废待兴，欣欣向荣。在思想政治上贯彻唯物主义、崇尚科学、提倡社会新风的大背景下，顾老高瞻远瞩，洞悉未来，进一步阐释药师法的圆融宗旨：“药师法既不离世间法，故必会通世间科学如自然科学、社会科学以为研究，才能打破宗教的偶像、教条和迷信等等。又药师法既不离出世间法，故亦必会通佛法大乘教义如菩萨行愿、庄严佛国等以为研究，才能打破时间的小我、妄执和主观等等。这便是我的药师经读法。”

“圆融大小、圆融显密、圆融真俗、圆融二世”一语出自吴信如大阿阇梨所撰《我的教判与行持》一偈，吴老所著《佛教各宗大义》收录。